事業提檔案做法和待遇問題

我是2008界的.本科畢業生。
4月份本市的一事業單位經過筆試、面試，說定要我了。
可一直不籤協議，畢業的時候，單位說讓我先把檔案掛人才市場。
我從4月份開始邊做畢業設計邊在單位實習，實習期間有1000元的生活補助。7月份畢業後，全職在單位上班至今，待遇和實習期間相同。
然後8月28號直接簽訂了勞動合同，簽訂3年，月固定工資1500，又說9月，10月，兩個月是實習期，實習期間工資拿1500的80%。
然後說從人才市場調我檔案進單位，卻說不能按應屆畢業生學校改派路線走，必須走社會招聘路線。
請問，檔案按應屆畢業生學校改派走和按社會招聘走，有什麼區別？
是不是社會招聘的人員不享受單位正式編制，不享受相關福利？