最近原國企說寄檔案時忘了放我的實習和辭職證明

我剛工作不到一年，而國企實習期的.一年間辭職的。現在一所國家屬大學工作。
主要困惑是，辭職證明是通過任免檔案的形式寫的（上有××單位任免通知字樣），內容是我因個人原因提出辭職，原單位同意並批准解除勞動關係。他們說會涉及到一年後的幹部身份轉正問題，還說建立了勞動關係就相應有一個解除手續，這樣說是否合理？即使合理，請問這種用“任免檔案”形式說我“自動辭職”的檔案，從人事制度上說是否應當放進檔案？放進去好還是不放好？即使應當放進去，現在檔案已經轉了，新的人才市場會同意接收嗎？
我還有一位同事情況和我一樣，他現在所在工作單位也是學校，但是原單位說他在學校沒有編制，所以不能和我一樣操作，還要再做處理。而我在現在單位是有編制的，所以要這樣操作。是這樣嗎？